Нужна помощь: какой налоговой платить??

есть фирма в СПб (нулевая отчетность) и ее филиал в Карелии, все налоги платятся в Карелии и деятельность там же показывается.
на филиал пришло требование о внесении изменений в налоговую отчетность:
Согласно ст. 288 НК РФ, налогоплательщики, имеющие обособленные подразделения, исчисления и уплату в Федеральный бюджет сумм авансовых платежей, а также сумм налога, исчисленного по итогам налогового периода, производят по месту своего нахождения без распределения сумм по обособленным подразделениям. Из этого следует, что филиал должен начислять и уплачивать суммы авансового платежа и налога только в бюджет субъекта.
Вам необходимо предоставить корректирующие налоговые декларации по налогу на прибыль организации.

А вопрос такой, я не понимаю, что и кому я должна предоставить, и где мы должны платить налоги в СПб или Карелии.

Именно так и надо платить как вам написали: считаете налог на прибыль в целом по всему предприятию - все вместе -есть деятельность или нет ее. Ту часть налога которая относится к федеральному бюджету (6,5% из 24) платите в СПБ по месту основной регистрации. Туда же и авансы по этому бюджету. А остальные 17,5% (сумму налога ест.) распределяете пропорционально по СПБ и в Карелию т.к. это разные субьекты. Пропорция- средняя арифметическая удельного веса среднесписочной численности работников(или расходов на оплату труда по налоговому учету- но это сложно) и удельного веса остаточной стоимости амортизируемого имущества(это тоже надо брать по данным налогового учета).
Пример: 2 чел. в СПБ, 98 чел. в Карелии.Доля СПБ =0,02; Карелии =0,98,
ОС на 10 т.р в СПБ и на 90 т.р. в Карелии. Доля СПБ= 0,1; Карелии =0,9.
Средняя по долям: СПБ = 0,02+0,1/2=0,06 ; Карелия=0,98+0,9/2=0,94. Так что если в СПБ есть (числится) хоть один человек (наверное руководитель все же в СПБ) или его оплата труда, да еще если возле него стоит компьютер и сидит он в вашем недвижимом и рядом еще ваш авто зарегистрирован то отделите и заплатите в СПБ его долю субьектного налога =0,06. Доли по моему до двух десятичных округляются-точно не помню.

Декларацию тоже в два места. В спб полную.В карелию титульный лист,раздел 1 и приложение 5