Госконтракт, разница в стоимости!!! Срочно нужна помощь!!!

Выйграли тендер и подписали госконтракт на смр, стоимость в контракте на основании сметы,
в итоге по завершению работ получили - акт по факту на меньшую сумму, заказчиком еще не проплачивалось, заказчик отказывается подписывать акт на основании расхождения в стоимости контракта и КС-2
У заказчика федеральное финансирование, они настаивают на полной стоимости контракта...
Изменение такое в стоимости было вызвано разницей по факту в количестве и коэф., который изначально были среднегородскими, а наши только готовились... а КС-2 составлен уже на основе полученных коэф. для нашей организации...
Как быть???

С бюджетом не поспоришь, наверняка там будут учитываться только федеральные коэффициенты, а на местные им глубоко наплевать. Ищите компромисс. ;)