Ответственности нужно бояться только 2 месяца?

Подскажите пожалуйста про срок давности по нарушениям с ККМ. Если я , например, 01 июля выдала ПКО без чека ККТ в оплату за оказанные услуги юр.лицу, то меня могут наказать только если обнаружат это до 1 сентября? А если проверка придет 5-го сентября? То меня накажут только за те ПКО без чеков ККТ, которые выданы после 5-го июля? или я все путаю?

Вроде не путаете. Срок по КоАП действительно 2 месяца.

Неприменение ККМ только при контрольной закупке можно обнаружить. , и именно в этот момент, даже время фиксируется. Позже, по ПКО - это уже недлящееся правонарушение.

Неприменение ККМ действительно суд отнес к недлящимся правонарушениям.
Постановление ФАС Московского округа от 04.01.2003 № КА-А41/8451-02. Может есть и еще практика - больше не искал.
В логике судов длящееся правонарушение прекращается вмешательством органов власти.
См., например, Постановление ФАС Моковского округа от 20.01.2003 №КА-А40/9064-02.