Транспортные расходы в стоимости МПЗ. Налоговый и бухгалтерский учёт.

Всем привет.

Подскажите пожалуйста ответ на следующий вопрос, никак не могу разобраться. Возникают ли разницы при бухгалтерском и налоговом учёте ТЗР в стоимости МПЗ?
Исходя из смысла ПБУ 5 и Методических указаний по бухучёту, в бухгалтерском учёте мы можем учитывать ТЗР как в себестоимости приобретённых МПЗ, так и путём распределения их стоимости пропорционально стоимости приобретённых материалов.
Но исходя из смысла п.2 ст. 254 НК РФ стоимость МПЗ определяется исходя из цен их приобретения.
Т.е., если мы имеем транспортную организацию, которая транспортирует несколько партий нашего товара, и выставляет один комплект документов на транспортировку, и в бухгалтерском учёте распределяем стоимость этих ТЗР на стоимость материалов, то в налоговом учёте мы не можем этого сделать? Каким образом тогда распределить стоимость этиз ТЗР по стоимости материалов? Как следить за образовавшимися разницами? И образуются ли эти разницы?

Заранее спасибо за ответы!