НДС при строительстве у инвестора

Подскажите, пожалуйста, как быть. Мы выступали инвестором в строительстве офиса. Офис построила для нас специализированная фирма, передала нам его мы оформили право собственности. Во время строительства мы перечисляли деньги строительной фирме. Кроме этого мы наняли консультанта по строительству, который следил за всем процессом, также мы покупали некоторые материалы и передавали их стр. фирме.
У нас прошла проверка, и по результатам нам сказали что мы должны были начислить НДС со всей суммы, затраченной на строительство ( в том числе и на те , которые мы перечисляли по договору долевого строительства) Правильно ли это и где про это конкретно почитать.

Чего-то я не поняла: как это "начислить НДС со всей суммы, затраченной на строительство"?
Они Вам пытаются строительство хоз.способом приписать? А на каком основании? Опишите поподробнее ситуацию.

в декабре мы заключили договор долевого участия на строительство офиса. Подрядчик, который строил, использовал для себя не очень красивые материалы, поэтому для своей части мы покупали сами обои, краску и т.д. Кроме этого наняли человека, который следил чтобы наши материалы расходовались туда куда надо. В результате подрядчику по договору мы заплатили 3 млн. руб., а на содержание прораба и на материалы ушло около 500 т.р. И вот проверяющие теперь говорят что мы должны с 1500 т.р. начислить НДС и заплатить. А поскольку мы ведем деятельность в большинстве своем не облагаемую НДС ( Ценные бумаги) то потом возместить его мы не сможем. Вот такая канитель получается.

они нам приписывают п1. ст. 166 НК

К договору долевого участия у Вас могло быть дополнительное соглашение в котором указано, что обеспечение строительства материалами (лучше указать какими именно) возлагается на дольщика (в счет оплаты своего долевого участия - это если в КС2 не вычли стоимость материалов). Тогда можно будет с уверенностью говорить о том, что Вы осуществляли лишь инвестирование строительства (кстати НДС при покупке материалов Вы не должны были возмещать). Если пункта о том, что обеспечение строительства материалами возложено на Вас не будет, то передача их может быть трактована как реализация... А Вашему прорабу можно написать должностную инструкцию, согласно которой он и швец и жнец... , т.е. относится к АУП, несмотря на наименование должности. По акту Вам передали готовый объект со счет-фактурой впридачу, Вы зарегистрировали свое право собственности на объект. Вы - инвестор - и точка!!! Никакого строительства хоз.способом. Попробуйте, но консультация юриста все равно нужна, я сама- бухгалтер, а здесь возникают юридические тонкости с определением того каким договор является по сути с точки зрения ГК.