Работница выходит на пенсию, что-нибудь меняется в учете?

1. Меняется ли налогооблажение з/п?
2. В чем разница оформления по трудовой и по совместительству? Только в предоставлении вычетов по НДФЛ или что-то еще?

1. Налогообложение не меняется.
2. Вычеты могут быть предоставлены и совместителю, если он заявление написал именно в эту организацию. А по особенностям совместителей читайте ТК, там отдельная статья этому посвящена.