3-НДФЛ или 6% на упрощенку?

Прошу помочь! Ситуация следующая: Продается нежилое помещение (Договор купли-продажи от физ.лица) в 2008 году,в собственности было менее 3 лет,покупалось образно за 5 рублей продалось за 4 рубля.Налоговая затребовала сдачу 3-НДФЛ,вроде бы все по закону .Но...,это помещение было использовано в целях предпринимательской деятельности,т.е. сдавалось в аренду ,по-скольку это физ.лицо зарегистрировано в налоговой как ИП на УСН 6%.И соответственно 4 рубля я должна показать как доход в декаларации УСН и заплатить 6% от этой суммы. Или нет? Помогите разобраться.

Ну если налоговая хочет 3-НДФЛ, то и хорошо, Вам же выгоднее.