Оплата юриков кредитными картами

Добрый день. Не знаю точно правильно ли я выбрала раздел, но прошу помощи. Подскажите пожалуйста в следующем: имеется касса, на ней используются 4 отдела ( 2 отдел - оплата кредитными картами, 4 отдел - для юр. лиц за наличку, с выделенным НДС). Когда организация хочет оплатить кредитной картой, как быть? если же им нужна счет-фактура, то соответсвенно и чек по кассе с выделенным НДС, правильно же? если мы дадим вместе со счет-фактурой чек без выделенного НДС, чем это чревато? может кто подскажет где про это можно почитать....что-то никак не могу разобраться:(

заранее всем спасибо огромное