Реализация в "Декларации по прибыли"

Мы не проф.участник рынка ЦБ,но ЦБ являются нашей основной деятельностью,возникло сомнение где я должна в декларации отражать выручку по ЦБ,в Листе 05,или в Листе 02 Приложения №1

Лист 05. Это связано с особым порядком расчета налоговой базы, по-другому просто не получится.

Спасибо ,я так и делаю .

А если в декларации возникает налог на прибыль,я его начисляю в БУ

Вы имеете ввиду именно по операциям с цб?

Да по ЦБ

Вы начисляете общую сумму по стр. 380-400. При желании можно завести какую-нибудь аналитику и отдельно начислять по цб и прочим операциям, но зачем?
P.S. Я не знаю, как д.б., если используется ПБУ 18/02.

Я так поняла,если используется ПБУ 18/02 программа сама заполняет декларацию по прибыли

Программу люди пишут. Не факт, что они все правильно делают.