Расчеты с НДС при УСН

ООО УСН 6%, Директор подписал договор с НДС, теперь контрагент просит сч/ф и отказывается от окончательного расчета, что мне делать.

что скажет директор, то и делать

Либо переделать договор, либо уплатить НДС и выписать сч.фактуру