Выцвели Z-отчеты

Сильно выцвели Z-отчеты, хотя и хранятся в закрытой папке... Может это создать проблемы с налоговиками?

Может.
Поэтому сейчас и советуют иметь заверенные копии подобных документов.

но ведь всегда можно распечатать отчет за период... и там будут суммы по каждой закрытой смене