НДС с пени

наша фирма выиграла суд. По решению суда помимо задолженности, нам перечислили пени. Облагается пени НДС?

А Вы покупатель или продавец?
Вообще то НЕТ, не облагаются, но
Если Вы покупатель то без проблем НЕТ, а если Вы продавец, то есть вероятность, что ФНС захочет обложить, но в ответ на это можно привести судебную практику, в соответствии с которой - санкции за просрочку (в Вашме случае пени, не связаны с оплатой за товар)

Мы Подрядчики. Были выполнены работы, а оплаты не было, поэтому и судились.

на сумму работ начисляете НДС, на пени - нет.

Эти пени облагаются только НП, причем в момент вступления в силу решения суда. и совершенно независимо от факта фактической оплаты. Если конечно у Вас метод начисления.