обособленное подразделение

организация создала обособленное подразделение, нужно ли сейчас уведомлять об этом фонды? (налоговую понятно что надо уведомить)

Нужно.

какие нужно? все? даже если нет отдельного баланса и счета?

ПФР и ФСС. ПФР и ФСС. Даже если нет.

А есть ли санкции за неуведомление фондов?

Есть. http://mvf.klerk.ru/spr/spr22_3.htm

Можно ли уведомить фонды электронным письмом?

ФСС - нет. ПФР - где как, узнавайте по месту.