Отказ по налоговому вычету

Прошу у вас помощи. Ситуация следующая...Начали новое строительство жилого дома в 2005 году. В 2008 году отчитались по форме 3-НДФЛ за 2005,2006,2007 г. на самму 250 000 руб. Получили возврат по НДФЛ 32500 руб. Тогда же в ноябре 2008 г. получили свидетельство собственности на жилой дом. Получать нужно было срочно, так как выставили на продажу квартиру, чтобы достроить дом и нужно было где-то прописываться. На тот переиод вычет предоставлялся не более 1 млн. рублей. В декабре 2011г. подали в налоговую декларации за 2008, 2009, 2010г. на оставшиеся 750 000 руб. В марте получен отказ в вычете. Налоговая ссылается на то, что свидетельство на жилой дом получено, значит он достроен, а все расходы за 2008/2010 это не строительство а ремонт, следовательно не положено. А так же пишут, что мы подаем документы для предоставления вычета в 2 млн. руб, а повторно вычет не дается. То есть получается, что мы воспользовались вычетом только на 250 000, а 750 000 повисли в воздухе. Ничего не понимаю, хотим для начала написать разногласия, вдруг что-то проясниться, в дальнейшем планируем обрашаться в суд. Может кто-то поможет прояснить ситуацию??? Заранее огромное спасибо!!!
Может еще попробовать корректировку сдать за 2005-2007г.г.? с приложением документов на оставшуюся сумму? Чеки есть. И еще, свидетельсво было получено в ноябре 2008 года, то есть мне совсем не понятно, почему не приняли к зачету расходы за январб-октябрь 2008г.