подтверждение полномочий - годовой протлокол/решение

Должен ли единственный участник, который одновременно и Ген дир
ежегодно подтверждать свои полномочия как ген дира решением?
Кажется, абсурдно, не должен...

Что у вас в уставе написано? Если по уставу директор назначается на один год, то абсурдно, что вы считаете это абсурдно ))
Пропишите что директор назначается на неопределенный срок, и подавайте новый устав. Если не хотите, тогда каждый год подтверждайте полномочия.