Доп соглашение к трудовому договору "задним числом"

В этом году провели индексацию заработка сотрудников. Стала изучать, как правильно документируется эта процедура и выяснилось, что необходимо оформлять допсоглашения к ТД с каждым из сотрудников. Вспомнилось, что в папке с трудовыми договорами ничего подобного нет, хотя индексация в фирме уже проводилась не раз. В самих ТД тоже ни слова об индексации. Нужно ли "задним числом" оформлять допсоглашения, в том числе и об индексации вообще, как требует ТК (т.е. что работодатель обязуется проводить индексацию)? Или оформить как положено только последнее?
У кого нибудь были прецеденты с трудовой инспекцией?

Никто не сталкивался?

А такой вопрос: обнаружила, что ТД оформлены с ошибкой: нарушена нумерация пунктов, а именно 2 пункта с номером 5. Как на грех именно в пятый (а по факту шестой) пункт я вношу изменения. Нужно ли это как-то исправлять?