С какой суммы платить 6%

Добрый день!
У меня 2 вопроса:
1) Фирма ООО на УСН 6%. Эта фирма-посредник. На счет фирме перечисляют деньги за товар по одной цене, а фирма дальше продает другой по второй цене. Допустим. На счет фирме перечислили за песок 300 000 рублей, она продала этот песок другой за 250 000 рублей. Может даже не снимать деньги, а сразу перегнать с р/с на другую фирму. Так с какой суммы нужно будет платить 6%? Если платить с 300 000, то это слишком много и эти деньги же не все являются прибылью. Род деятельности фирмы - организация перевозок грузов.
2) Прошу подсказать по поводу проводок по покупке данного песка. Все-равно песок надо приходовать в фирме, даже если фирма просто перегоняет деньги?
3) Если ООО на УСН будет выставлять счет с НДС, то ООО, если захочет, может уплатить в бюджет этот НДС, на свое усмотрение. Но если ООО на УСН платит НДС, то покупатель только через суд сможет вернуть из бюджета этот НДС? А если не платить, как покупатель узнает, заплатили ли в бюджет НДС по данному счету? И не возникнет ли у налоговой вопросов, почему НДС не был данной фирмой уплачен?

У Вас все оформляется посредническим договором или как?

пока никак не оформлено. Как правильно оформить, чтобы не платить 6% со всей суммы денежных средств за песок, т.к. истинный доход фирмы не будет равен цене песка? Сводить окончательного покупателя и истинного владельца песка само собой не выгодно для фирмы.

Я может не совсем понимаю о чем вы пытаетесь донести.
Но если Ваша прибыль является комиссионное вознаграждение, тогда 6% вы будете уплачивать в соответствие со статьей 251 НК РФ. п 9.
Но тогда все должно быть оформлено или договор комиссии, или договор поручения, или агентский договор.