Штатное расписание, оплата труда и трудовой договор...

Хотел бы проконсультироваться на предмет наличия нарушений.
Имеется федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего профессионального образования, далее просто Университет.
В структуре Университета создается учебно-научная лаборатория, имеющая признак официальной идентификации в структуре Университета, по хозрасчетному принципу (100% хозрасчет), что прописано в положении. Согласно приказу о создании структурного подразделения, включаются в штатное расписание лаборатории штатные единицы с должностными окладами и фондом оплаты труда из средств лаборатории... Лаборатория не является юридическим лицом. Лаборатория в процессе организации несколько месяцев (около 6), т.е. отсутствует помещение и оборудование. Работники лаборатории выполняют работы по дополнительным соглашениям к основному договору и за счет этого поддерживают свою жизнедеятельность. По основной работе заработок отсутствует полностью - нет даже минимальной оплаты, т.к. лаборатория не начала полноценно функционировать и средств у лаборатории нет. Однако, со стороны Университета, т.к. сотрудники лаборатории в штате Университета, имеются требования к выполнению всех типовых правил отчетности, учета, планирования и поддержки административно-хозяйственных мероприятий Университета, соблюдения отпусков и отгулов, соблюдения процедур переизбрания сотрудников лаборатории и др..
Не противоречит ли нулевая заработная плата по основной работе ТК (трудовому кодексу) в описываемом случае?

Добавлю, что по основной работе работники лаборатории заключали стандартный для Университета "Трудовой договор", где:
- в п.2 "Права работника" прописано: "2.1.3. Своевременную и в полном объеме выплату заработной платы в соответствии со своей квалификацией, сложностью труда, количеством и качеством выполненной работы";
- в п.5 "Обязанности работодателя" прописано: "5.1. Своевременно и в полном объеме выплачивать заработную плату Работнику, обусловленную настоящим трудовым договором в установленные сроки";
- в п.6.1. Оплата труда Работника определяется Коллективным договором (с приложениями), локальными нормативными актами, нормативными правовыми РФ, содержащими нормы трудового права, настоящим трудовым договором.
- п.6 "Порядок оплаты труда", подробно расписано, что заработная плата выплачивается 10 и 25 числа каждого месяца, что устанавливается должностной оклад, но его просили не вписывать и оставить поле пустым...
- в п.6.2.3. описываются стимулирующие выплаты, одна из которых "доплата за интенсивность труда ___ рублей из внебюджетных средств".
- в п.7 "Условия труда и отдыха" расписано, что продолжительность рабочего времени работника 40 часво в неделю с 5-ю рабочими днями и выходными суббота и воскресенье, начало работы в 9 часов, перерыв с 13 по 14 и окончание рабочего дня в 18 часов.