НДС по ремонту арендованного здания?

Некоммерческое партнерство заключило договор аренды с Росимуществом. Зданию нужен был кап.ремонт. В договоре написано что затраты на капремонт снижают размер арендной платы. Для ремонта здания заключили договор с подрядчиком (у них есть лицензия).
И вот все работы завершены, осталось все документы преоставить в Росимущество.
У НП освобождение по НДС. Будет ли считаться реализацией то что мы делали ремонт с привлечение сторонней организации (не хоз.способом) и передали Росимуществу? А сумма большая.
Может я не совсем понятно написала?