Совпадение суммы в счете?

Организация выставляет нам счет на определенную сумму.
Мы не хотим брать несколько позиций из счета, поэтому проплачиваем меньшуу сумму. Нам поставляют товар с ТОРГ_12 и счет-фактурой.
Моя бухгалтерия еще требует исправленный на меньшую сумму счет в оригинале с печатью. Разве это обязательно? Счет является каким либо определяющим документом? Ведь есть сумма, проведенная контагенту через банк, есть накладные и счет-фактуры от него на эту сумму.
Зачем задним числом еще переделывать счет?

Не обязательно, но так удобнее.

Так у меня такой шум устроили. Будто это грубейшее нарушение. Поставщик в другом городе. Так что просить его переделывать не очень удобно.
Так всё таки это прихоть бухгалтерии- или нормы ведения бухучета?

Прихоть.

Напускная строгость бухгалтерии иногда мешает работать, кстати и им же тоже.