Как правильно списать копейки

Как правильно(какой операцией) списать суммы возникшие при уплате и начислении налогов на продажу(0,01) и пользователя автодорог(1,00) или они должны висеть вечно на 68 сч? В 1:С 7,70.588

Сделали проводку в операцию введённую в ручную Д91,2-К68,6 сумма закрылась автоматически, но на декларацию по прибыли ни как не отразилось, копейку искать не будем, но рубль должен был появится в декларации на прибыль(???), или эта сумма автоматом списалась на 91,9, а от туда на 84 и на расчет прибыли это не как не повлияло?
И еще вопрос, срок исковой давности о возврате суммы истек, кроме как приказа директора предприятия о списании переплаты, достаточно, или нужно подавать в налоговую письмо?

Прошу ответить какая будет правильная операция по списанию переплаты по налогам:
-бухгалтерской справкой(с отражением в НУ) или
-операцией введённой в ручную(без НУ)?