НДС с не резидентом

Здравствуйте форумчане! Подскажите пожалуйста! Мы российская организация на классической системе,у организации Казахстан заказали услуги по подготовке, сбору и оформлению документов для регистрации в РГП "Национальном центре Экспертизы ЛС, ИМН и МТ" медицинской техники, консультационная поддержка по регистрации, представление в уполномоченных государственных органах, дополнительные услуги: перевод документов. У меня возник вопрос: Являемся ли налоговыми агентами по НДС? Должны ли мы уплатить в бюджет РФ НДС или место реализации услуг будет не РФ? Помогите пожалуйста, впервые столкнулась с такой операцией?

Всё это вполне тянет на "консультационные услуги", тогда место реализации РФ - вы агент. Но надо внимательно смотреть договор. предмет, обязательства сторон, расчет цены за весь комплекс услуг или частями. Смотрите приложение 18 договору о ЕАЭС (Протокол о порядке взимания косвенных налогов)

Если местом реализации услуг не является территория России, то объект обложения НДС по российскому законодательству не возникает (подп. 4 п. 1 ст. 146 НК РФ, п. 28 приложения 18 к Договору о Евразийском экономическом союзе). Сумму НДС (его аналога), уплаченную иностранным контрагентам по законодательству других государств, к вычету не принимайте. Вычеты, предусмотренные пунктом 2 статьи 171 Налогового кодекса РФ, на суммы налогов, уплаченных за рубежом, не распространяются.
(Белорусская (казахская, армянская, киргизская) организация не состоит в России на налоговом учете)

Если местом реализации услуг является территория России, то заказчик услуг, оказанных белорусской (казахской, армянской, киргизской) организацией, должен исполнить обязанности налогового агента по НДС (п. 1 ст. 161 НК РФ, п. 28 приложения 18 к Договору о Евразийском экономическом союзе). То есть удержать и перечислить в бюджет НДС со стоимости оказанных услуг. После уплаты сумму входного налога заказчик вправе принять к вычету (п. 3 ст. 171 НК РФ).
(Белорусская (казахская, армянская, киргизская) организация не состоит в России на налоговом учете)

То есть, мы заказчики услуг и соответственно место реализации услуг РФ, поэтому выступаем налоговым агентом и должны начислить , удержать и уплатить ндс в бюджет одновременно с перечислением аванса организации Казахстан?

Да.
срок уплаты НДС по работам (услугам), исполнителями которых являются иностранные организации, не состоящие в России на налоговом учете: Налоговый агент обязан перечислить удержанный налог в бюджет одновременно с выплатой денежных средств иностранным организациям (абз. 2 п. 4 ст. 174 НК РФ, письмо Минфина России от 1 ноября 2010 г. № 03-07-08/303). При этом банкам запрещено принимать платежные поручения на перевод оплаты исполнителю, если одновременно с ними заказчик не предъявил платежное поручение на перечисление НДС в бюджет (абз. 3 п. 4 ст. 174 НК РФ). Поскольку обязанность по уплате НДС должна быть исполнена в денежной форме, порядок применения зачетов, предусмотренный пунктом 1 статьи 78 Налогового кодекса РФ, не применяется. То есть в счет погашения задолженности по НДС, возникшей при приобретении работ (услуг) у иностранных исполнителей, налоговый агент не может зачесть суммы имеющейся у него переплаты по другим федеральным налогам. Об этом сказано в письме Минфина России от 28 сентября 2012 г. № 03-02-07/1-231.

Независимо от того, в какой форме выплачены доходы (в денежной или натуральной), налоговый агент обязан рассчитать сумму налога к удержанию. Однако удержать эту сумму он должен только из денежных средств, выплачиваемых контрагенту. Об этом сказано в подпункте 1 пункта 3 статьи 24 Налогового кодекса РФ.
(т.е. сразу оговаривайте сумму, которую нерезидент хочет получить- если вы оба новенькие в этом деле, а то сюрприз будет в недополучении денег)

Большое спасибо. Все поняла.