Возврат переплаты от факторинговой компании без указания НДС

Добрый день.
Прошу помощи и правовой поддержки.
Ситуация следующая: Есть компания-поставщик, расчеты с которой по некоторым поставкам оборудования мы производим через факторинговую компанию. В трехстороннем соглашении, которое подписала наша компания, есть приложение с образцом заполнения платежного поручения по таким платежам. "Оплата за комплектующие по счету-фактуре (накладной) №...дата. Сумма.... В т.ч. НДС 18%..."
По одному из счетов мы ошибочно заплатили дважды, т.е. образовалась переплата. Руководством было принято решение написать письмо в факторинговую компания о возврате излишне перечисленных денежных средств. В письме были указаны реквизиты платежного поручения, по которому перечислили ошибочный платеж, сумма и входящий в нее НДС.
Факторинговая компания перечислила нам переплату, однако в платежном поручении в графе назначение платежа указала: "Без НДС". На просьбу написать письмо, что данная сумма содержит НДС (т.к. переплата была произведена с НДС), факторинговая компания ответила категорическим отказом без ссылок на норм. базу. Аргумент - факторинговая компания работает без НДС!!! У нас другая позиция, но не могу найти прямых ссылок на законодательство, кроме принятых правил делового оборота: Если перечисление с НДС, то в возврат с НДС.
Помогите составить аргументированный ответ.
Возможны ли какие-то налоговые риски по НДС, если мы оставим возвращенные деньги без НДС и не будем дальше требовать от факторинговой компании письма с выделением в платеже НДС?