Прием на работы гражданина со статусом беженец.

Здравствуйте!
Подскажите пожалуйста, при приеме по трудовому договору работника со статусом "Беженец" (гражданство Афганистан) , все документы в наличии ( снилс ,инн,мед страхование, удостоверение беженца) какие моменты надо учесть и надо ли уведомлять ИФНС ПФР И ФСС о приеме на работы сотрудника с таким статусом.

Спасибо

Нет. Уведомлять надо только ФМС. Но надо обратить внимание на миграционный учёт и на перемещение беженца. Смотрите, где выдано удостоверение беженца, где ему разрешено проживать.
Беженцам при переезде необходимо сниматься с учёта и вставать на учет по новому месту нахождения. И хотя это звучит, как постановка на миграционный учёт, это немного разные вещи.
А по миграционному учёту из игилоопасных стран - особый контроль. В районных ФМСках это не делается.
Не знаю какой у вас регион, но, например, постановка на МУ в Московской области для таких категорий осуществляется на Солянке.