Списание при двух видах деятельности УСН и ЕНВД

Добрый день! Подскажите пожалуйста, можно ли списать брак и недостачу товара только по ЕНВД, при совмещенном учете ЕНВД и УСН доходы-расходы?

Конечно можно. Что там вы списываете по ЕНВД, налоговую не волнует.