Декларирование резидентом РФ дохода и счетов за границей

Здравствуйте.
Подскажите пожалуйста как правильно поступить в следующей ситуации:
Человек (клиент) работает на Кипре по найму в иностранной организации с апреля 2015 года, получает зарплату на банковский счет открытый в кипрском банке. При этом считает что сохраняет статус резидента РФ, так как находится на территории РФ более 183 году (подтверждает это штампами в загранпаспорте). Но! Ни разу не подавал декларацию 3-НДФЛ, не исчислял самостоятельно НДФЛ подлежащий уплате, соответственно не платил. К тому же не декларировал в налоговой банковский счет, открытый в иностранном банке, на который он получает доход от работы по найму в иностранной организации.
В апреле 2017 года заканчивается старый контракт и человек заключает новый контракт на тех же условиях с тем же работодателем с апреля 2017 года. Также он открывает осенью 2017 года новый банковский счет в иностранном банке, декларирует его в российской налоговой в установленные сроки (в течение месяца), получает на этот счет доход от работы по найму по новому контракту. Также он закрывает осенью 2017 года старый счет, не декларируя его в налоговой.
Он хочет в 2018 году задекларировать доходы начиная с апреля 2017 года (времени нового контракта), то есть подать 3-НДФЛ, уплатить НДФЛ если потребуется.
Как это сделать правильно и красиво, чтобы не возникало каких-либо рисков по предыдущим периодам? Насколько я понимаю ему для подтверждения дохода при подаче 3-НДФЛ нужно будет приложить декларацию с отметкой кипрской налоговой, для того чтобы воспользоваться соглашением об избежании двойного налогообложения и уплатить только разницу между уплаченным на кипре подоходным налогом и 13% в РФ, но в которой будет четко видно что он получает доход с начала 2017 года. Или ее прикладывать не обязательно, а можно приложить банковскую выписку с нового счета и уплатить 13% со всей суммы поступлений?

Также есть еще обстоятельство, которое вроде не должно влиять на вышесказанное: человек зарегистрирован как ИП в РФ, и платит 6% с доходов ИП в РФ.