Транспортные услуги из РБ

Российская компания приобрела услугу по перевозке груза из РБ. Исполнитель- резидент РБ. Является ли российская компания агентом по косвенному НДС?

нет.
место реализации услуг по перевозки в вашем случае - Беларусь.