В п. 3 ст. 161 речь идет о предоставлении имущества Росимушеством, КУГИ или КУМИ. В случае же с учреждениями образования и науки, а также некторые иными, последние имеют право быть именно арендодателями. То же Росимущество лишь осуществляет учет подобных договоров и согласование, при этом само оно не сдает имущество в аренду (не явлется арендодателем), а значит эта ситуация не подпадает под п. 3 ст. 161 НК РФ, поэтому учреждения платят налог на вполне законных основаниях.
