Вообще-то даже можно и с 2008, 2007 года попросить предоставить вычеты, лишь бы было право на них. Минфин согласен (письмо Минфина РФ от 25.08.2009 N 03-04-06-01/222), что налоговый агент может сделать возврат НДФЛ за 3 последних года, даже если сотрудник уже уволился. (п.7 ст. 78 НК РФ)

