Re: Есть акт и счет-фактура, электронный билет.
Так, у Вас есть: " акт и счет-фактура, электронный билет". Полагаю командировочное удостоверение оформлено и отштамповано, Отчет в задании по командировке тоже сделан? Что еще нужно?
Видеозапись входа пассажира в вагон?
От Вас требуется доказать что он пункте назначения был и задание исполнил = экономическая целесообразность расходов.
Если при проверке налоговик выяснит, что Ваш сотрудник "вечерней лошадью" в командировке передвигался и сей факт документально подтвердит, тогда у Вас проблемы будут. Во всех остальных случаях, на мой взгляд – пакет у Вас достаточный.