Импорт услуг по разработке ПО из Беларуси

Российская компания заключает договор на разработку ПО с белорусской организацией. Место реализации услуг - территория РФ.
Одновременно с оплатой работ белорусской компании российская организация обязана удержать и перечислить в бюджет Российской Федерации сумму НДС, рассчитанную по ставке 18/118. Получается, что мы перечислим не полностью сумму по договору, а за минусом НДС. Затем мы имеем право принять уплаченный НДС к вычету. А как быть с расчётами? Сумма ведь по договору не закроется. Буду благодарна за помощь.

Поэтому и закладывают сумму агенсткого НДС в стоимость договора, указав, что в цену оного включены налоги.