Вот со ставкой НДС лично мне ничего не ясно. Т.е. понятно уже, что это не грант ни разу, а обычная реализация, но возникает вопрос с суммой выручки. Т.е. какой из вариантов: общая стоимость 1180 ( с НДС), а вам
1. заплатили 1000 без НДС?
2. заплатили 1180, но указали что это без НДС?
Налог на прибыль за 2006 - корректируйте только годовую декларацию.
Директору скажите, что есть два варианта
1. доплатить налоги сейчас
2 доплатить их по результатам проверки +20% штраф.

