Если он еще и директор, тогда вообще все - нет никаких вопросов.
Единоличный исполнительный орган общества:
1) без доверенности действует от имени общества, в том числе представляет его интересы и совершает сделки;
Он имел полное право сколько угодно лично вносить деньги на р.счет, минуя кассу. Любые деньги - какие он сам сочтет нужным.
