Без разницы, какую деятельность ведет работник у ИП. Если ИП производит выплаты физицам, он не может уменьшить налог по УСН на 100%. Системы налогообложения тут ни при чем.
Вы дату начала деятельности должны были указать в заявлении о постановке на учет. Вот этой датой Вас и должны поставить на учет

