Можно воспользоваться и другими вариантами, которых несколько.
Первый состоит в том, что раздельный учет ведется исходя из предполагаемого использования товаров (например, на основе данных предыдущего месяца), а после корректируются суммы входного НДС, подлежащие вычету либо включению в стоимость. Минус этого способа в том, что представлять уточненные расчеты по НДС придется чуть ли не за каждый месяц (квартал, если он является налоговым периодом), ведь наверняка фактические данные не совпадут с предполагаемыми.
Второй вариант: выделить входной налог на дебет счета 19 и придерживать его там до тех пор, пока не станет известно, в каком режиме налогообложения будет продан товар. И только после появления этой информации сумму НДС либо ставить к вычету, либо переносить в дебет счета 41. Недостаток этого варианта в том, что если промежуток времени между приобретением товара и его продажей значителен, организация воспользуется вычетом позже, чем могла бы. К примеру, ценности были куплены и оплачены в апреле, но к вычету НДС бухгалтер не поставил, поскольку не знал, как и когда они будут проданы. Соответственно он применит вычет только в том месяце, когда необходимая информация ему будет предоставлена.
А можно сразу же ставить к вычету весь налог - третий способ. После чего сумму налога с части товаров, ушедшей через розницу (не облагаемую НДС деятельность), восстановить. Сразу оговоримся, что данный вариант достаточно смел и годится лишь для тех предприятий, у которых операции, облагаемые НДС, составляют основную часть. Если вас обвинят в нарушении, можно аргументировать свои действия тем, что купленные ценности предполагалось реализовать оптом, то есть с учетом НДС, но в последний момент руководство передумало, и товары было решено продать в розницу.