Грызут меня сомнения.
Подотчетник оплатил часть транспортных налом, часть ушла по безналу.
Документы на юр. лицо. Транспортная компания не заполняет строки к палтежно-расчетному документу в счетах-фактурах хоть убей их.
Есть счет-фактура, по идее фирма должна принять вычет по НДС, а у подотчетника перерасход. Расходы ему выплачены в следующем налоговом периоде.


