По мнению ИФНС, сумма подлежащего уплате НДС может быть определена расчетным путем, поскольку налогоплательщик, применяющий общую систему налогообложения и ЕНВД, не вел раздельный учет операций, облагаемых и не облагаемых НДС.
Как указал суд, признавая позицию ИФНС неправомерной, при отсутствии у налогоплательщика раздельного учета сумм "входного" НДС ИФНС в соответствии с требованиями п. 4 ст. 170 НК РФ должна была отказать ему в применении налоговых вычетов в полном объеме (за исключением восстановленного НДС). Доначисление НДС исходя из суммы необоснованно заявленных налоговых вычетов, определенной ИФНС расчетным путем, признано судом не соответствующим положениям п. 4 ст. 170 НК РФ и действительным налоговым обязательствам налогоплательщика, в связи с чем решение ИФНС о доначислении НДС признано недействительным.