Вот такая у нас проблема!
НДС, уплаченный таможне при ввозе оборудования на территорию РФ - не возмещают.
Наши пути таковы:
1. Сначала предъявили НДС по оборудованию, поступившему на 07 счет. Говорят: введите в эксплуатацию. (Кстати: Постановление ВАС СЗО от 12.09.02. Дело № А52/962/02/2).

2. Ввели в эксплуатацию один объект-говорят введите сначала весь завод. Начнете эксплуатировать, тогда и предъявите все.
3. Подаем в суд и на п1., и на п2.

Вот такие у нас проверки. Каждый день торчу в налоговой и все без толку.

P.S. И еще - даже если вы выиграете дело, то все равно придется каждый раз подавать в суд по одному и тому же вопросу. Как жаль, что мы не в Англии. (но в мне нравиться наша Россия).