Раздел 7 декларации по НДС и графа 9 книги продаж

[ВераНДС]

Должны ли быть показатели этих разделов равны друг другу?

[Сергей А.В.]

Нет.
Например, реализация ценных бумаг отражается в разделе 7 Декларации, а с/ф по таким операциям не составляются и, соответственно, в книгу продаж не попадают.