Ну это обычная практика ! Сверху давать советы - все горазды. Вы от них бамажку на этот счёт попросите - проверте реакцию.

Кстати это определено нашим ОСНОВНЫМ документом - "законом о бух учёте". Я про "если разногласия - от буха докладная, в ответ - ПИСЬМЕННОЕ указание действий".
Действавать в любом случае - Вам и Вашему диру! И ответственность за эти действия - Ваша и дира! Причём директора в этом случае - ОСНОВНАЯ.
В принципе - я бы тоже Вам это ПОСОВЕТОВАЛ бы. И сам ДЕЛАЮ ИМЕННО так !!!
ТОЛЬКО :
ОФОРМИТЬ ДОКУМЕНТАЛЬНО нужно ИМЕННО как написал выше. Почитайте этот вопрос в статьях по оформлению кадровых вопросов. В и-нете полно таких статей.
В заявлении и ПРИКАЗЕ НЕЛЬЗЯ писать "пропорционально (или за фактически) отработанное время" !
Вы бы этот вопрос лучше сами звонили. Директор - не бухгалтер, он на другом языке разговаривает

. Вы лучше друг друга поймёте.
не понятно: какое "остальное"?
Да ничего особенного. Выполнить указание, только оформить это в рамках закона.
Это ведь одно и тоже !

"Разницу" на самом деле видят ТОЛЬКО прокуратура и труд. инспекция. фсё !
Даже ревизорам по финансовой части - это без раницы: им лишь бы лишнего выплачено не было.