Добрый день, уважаемые эксперты!

Мы являемся налоговым агентом и приобретаем услуги по продаже продукции у иностранной фирмы - выплачиваем им агентское вознаграждение за найденных для нас покупателей продукции (% от поступивших денежных средств). Агент выставляет нам агентское вознаграждение - есть акт выполненных работ условно на 3540 у.е., в котором так же указано что 3000 у.е. получает собственно агент а 540 у.е. мы, российская организация платим в бюджет НДС. Однако по этому акту мы (за неимением оборотных средств) заплатили пока только 1/3, т.е. 1000 у.е. перечислили агенту, и 180 у.е. (по курсу в рублях) - в родимый бюджет НДС как налоговый агент.
Подскажите пожалуйста, на какую сумму я должна выставить счет-фактуру за нашего агента, и имею ли я право на возмещение уплаченного НДС из бюджета по итогам этого квартала (в котором был и акт и оплата). Не будет ли придирок со стороны нал. органа что т.к. услуги оплачены частично - то и возмещать пока права нет? Счет-фактура выставляется в рублях по курсу на дату оплаты или все же в у.е. (евро)?
Спасибо!