Договорились в Клиентом, что Заказчик на УСН 6% будет выставлять на свои услуги счет-фактуру с НДС (18%).
Заказчик на УСН будет сдавать декларацию и платить НДС в бюджет - смысл, есть хоть и не логичный, Клиент входит в концерн в котором с 2014г. жесткие указания - все контрагенты должны быть НДС-ки, и повышение цен на услуги на 18% их не волнует.

Вопрос с доходами, а в доходы по УСН будет вся сумма входить или без НДС, гугл дает противоречивые выводы и ситуацию с 6% не нашел