Тема: "Транзитный" НДС

Добрый день.
Столкнулся со следующим учетом НДС. У организации (производство) достаточно много покупателей. Доставка продукции им осуществляется железной дорогой. Железная дорога заключает договор именно с организацией, а не со всеми ее покупателями и выставляет все документы на организацию. Организация выставляет такие же (без наценки) документы своим покупателям за услуги ж.д. И ее (организации) бухгалтерия не показывает счета-фактуры полученные и выставленные в книгах покупок и продаж. И не отражает суммы НДС в декларации.
Насколько это правильно? И на основании чего, если правильно.

В теории искажения НДС нет. Но документы должны быть, иначе встречные проверки не пойдут ни с покупателями, ни с поставщиком. И еще при расчетах с покупателями, обычно их много, всяко бывает.

ИМХО, можно поступить и так, и эдак (проводить по счетам реализации с начислением/возмещением НДС, или выступить в качестве агента, как в Вашем случае), налоговики с Минфином и сами-то невнятно и несогласованно высказывают свою позицию. Поэтому делайте, как Вам удобнее, но на всязкий случай имейте аргументацию.
В Вашу пользу есть письмо Минфина от 10.03.2005г. № 03-03-01-04/1/103.

Спасибо, особенно за ссылку на письмо.
А как относятся налоговики к тому, что отгрузка и транспортные услуги в данном случае выставляются в одной накладной? То есть в книге продаж есть реквизиты счета-фактуры которые фактически с ним не совпадают (сумма, НДС).

Я это имел ввиду в т.ч.