Вот именно по этому поводу (соответствия удержаний в 6-НДФл и 2-НДФЛ) задал вопрос в ФНС. Центральный аппарат отвечать не стал, перенаправил запрос в областной. Судя по всему, они сами пока точно не знают, как должно быть и что чему должно соответствовать.

