Тут противостояние программистов и бухгалтеров

)
Вы просто включите расходы или в прямые, списывая их в себестоимость продукции. Или в косвенные, на 26-25, как удобнее.
Просто, насколько я понимаю программистов (хотя могу ошибаться), другого способа списывать прямые в торговле в пропорции к товару полученному-отгруженному, чем через 44, они не могли. И здорово кстати сделали!!!
Раньше я всегда в екселе вела регистр и списывала расходы в пропорции ручками.
Можно план счетов придумать рабочий какой угодно, но есть общепринятые стандарты, в торговле-44. в производстве 20 прямые, 26 косвенные.
Мне кажется, Вам удобнее сделать как реализовано в программе,чем терять время на выяснение ху из ху

))
А в разных инструкциях к плану счетов просто может быть путаница в понятиях товар-продукция. Кроме бухгалтера вообще мало кто понимает разницу