Извините, если у Вас криво поставлен документооборот, то это ваши проблемы, а не проблемы покупателя

А применение организациями ТОРГ-12 никто не отменял. И для нормального учета им нужна именно эта накладная, а не фиговый листок в виде товарного или кассового чека, который годится только для мелочевки типа канцтоваров на копеечные суммы.
Товар не должен списываться по кассовым чекам. Это ненормально. Потому что кассовый чек это всего лишь документ о получении наличных денег. А получены они могут быть, например, и как аванс.
Еще не хватало, что бы какие-то разработчики программ указывали своим заказчикам, как им документооборот ставить

И я не поняла, что мешает выписывать накладную не через этот ваш программный комплекс?
Кстати, когда нибудь какая-нибудь организация заявит вам, что товар она не получала, потому что не расписывалась в накладной о его получении, Вы быстро поймете разницу между кассовым (товарным) чеком и накладной
